Oligonukleotidien liuossynteesi
Laakkonen, Jouni (2018-11-27)
27.11.2018
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Julkaisun pysyvä osoite on:
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2018120750017
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2018120750017
Tiivistelmä
Oligonukleotidejä ja niiden modifikaatioita on tutkittu 1950-luvulta lähtien. Niitä voidaan käyttää esim. biokemiassa alukkeina ja antisense-lääkkeiden valmistuksessa. Oligonukleotideja voidaan syntetisoida monella eri menetelmällä. Yleensä oligonukleotidit valmistetaan kiinteänkantajan pinnalla syntetisaattorissa, mutta nykyään tutkitaan myös liuoksessa tai liukoisella kantajan soveltuvuutta oligonukleotidien synteeseissä.
Tutkielman kirjallisessa osassa käsitellään polyetyleeniglykolimonometyylieetterin ja ionisten nesteiden käyttöä liukoisina kantajina sekä H-fosfonaatti-, fosfotriesteri-, fosforamidiittimenetelmien ja dimeerisen fosforotioaattiyksikön soveltuvuutta oligonukleotidien valmistukseen.
Tutkielman kokeellisessa osassa tutkittiin sopivasti substituoidun pentaerytritolin käyttöä liukoisena kantajana. Työssä valmistettiin yhden kodonin mittainen oligonukleotidi. Nukleosidien liittämiseen käytettiin fosforamidiittikemiaa, joka toimi hyvin. Työssä saatiin myös kehitettyä yksinkertainen saostusmenetelmä, jolla voitiin korvata silikageelikromatografinen puhdistus.
Tutkielman kirjallisessa osassa käsitellään polyetyleeniglykolimonometyylieetterin ja ionisten nesteiden käyttöä liukoisina kantajina sekä H-fosfonaatti-, fosfotriesteri-, fosforamidiittimenetelmien ja dimeerisen fosforotioaattiyksikön soveltuvuutta oligonukleotidien valmistukseen.
Tutkielman kokeellisessa osassa tutkittiin sopivasti substituoidun pentaerytritolin käyttöä liukoisena kantajana. Työssä valmistettiin yhden kodonin mittainen oligonukleotidi. Nukleosidien liittämiseen käytettiin fosforamidiittikemiaa, joka toimi hyvin. Työssä saatiin myös kehitettyä yksinkertainen saostusmenetelmä, jolla voitiin korvata silikageelikromatografinen puhdistus.