Julkaisuarkisto
Viimeksi lisätyt
- Ladataan...Data-driven spectrum interpretation in the liquid phase
ArtikkeliväitöskirjaEronen, Eemeli
Turun yliopiston julkaisuja - Annales Universitatis Turkuensis, Ser AI: : 760 (Turun yliopisto, 2026-06-13)Interpreting liquid-phase electronic spectra is challenging due to the complex interplay of atomic motion and intermolecular interactions. These effects create a wide distribution of local atomistic environments, each of which can yield a signifcantly different spectrum. Because experiments only capture ensemble averages, any observed spectral change refects a latent shift in the underlying distribution of spectrally relevant structural features. In this thesis, I introduce a data-driven framework for disentangling the structure–spectrum relationship by adapting the recently proposed emulator-based component analysis. Applied to extensive simulated datasets, this spectrum-variance-driven dimensionality reduction method transforms the high-dimensional problem into a low-dimensional form, uncovering structural trends behind spectral changes. Across the studied cases, most of the spectral variation is explained by a small fraction of structural variance, represented by only a few latent structural degrees of freedom. This emerging pattern may indicate a general principle in spectroscopy of liquids. - Ladataan...Gene regulation of human T cells: Regulation of T cell differentiation and changes in T cells during progression of Type 1 Diabetes
ArtikkeliväitöskirjaBiradar, Rahul
Turun yliopiston julkaisuja - Annales Universitatis Turkuensis, Ser D: : 1971 (Turun yliopisto, 2026-05-29)CD4+ T cells have emerged as the central players of human adaptive immune system where effector and regulatory T cell subsets regulate various immune responses in health as well as during infections. However, when these immune cells are directed towards bodies own cells/tissues through autoantigen, they initiate autoimmune responses in diseases like rheumatoid arthritis, psoriasis, multiple sclerosis, inflammatory bowls disease and type 1 diabetes. Type 1 diabetes is chronic autoimmune disease where immune cells kill the insulin producing beta cells of pancreas. Detection of type 1 diabetes associated autoantibodies is the earliest clinical indication of the disease, it also conveys initiation of autoimmune process in pancreas. While disease associated changes have been detected in immune cells at the onset of disease, less is known about T cell changes that contributes to the initiation of the disease. Effector and regulatory CD4+ T cell subsets are associated with the initiation of autoimmunity. Uncovering disease associated changes in specific CD4+ T cell subsets before autoantibodies appear will help to better understand the disease process for possible immune modulation to delay or cure the disease. The work presented in this dissertation report comprehensive and detailed description of single-cell transcriptome of CD4+ T cell subsets from children progressing to type 1 diabetes, before the appearance of type 1 diabetes associated autoantibodies. The pathogenesis of several autoimmune diseases is linked to proinflammatory effector T cells known as T helper 17 (Th17) cells. Thus, these cells and their key regulatory molecules are being targeted for therapeutic approaches to manipulate Th17 cells in various autoimmune disease. The work presented in the dissertation uncovers new regulators of Th17 cell differentiation. The results indicate both FOSL1 and FOSL2 act synergistically and compete for the binding at BATF occupied loci of the key Th17 genes thus regulating Th17 differentiation. Moreover, epigenetic mechanisms regulate gene expression and the differentiation of Th17 cells. Our results show that a proximal enhancer present in RORA gene regulates Th17 cell differentiation.CD4+ T-solut ovat keskeisiä toimijoita ihmisen adaptiivisessa immuunijärjestelmässä, jossa efektori- ja säätely-T-solualatyypit säätelevät erilaisia immuunivasteita sekä terveessä elimistössä että taudinaiheuttajainfektioiden aikana. Kun nämä immuunisolut kuitenkin kohdistuvat elimistön omiin soluihin autoantigeenien välityksellä, ne käynnistävät autoimmuunireaktioita, jotka voivat johtaa autoimmuunisairauksiin, kuten nivelreumaan, psoriaasiin, multippeliskleroosiin, tulehduksellisiin suolistosairauksiin ja tyypin 1 diabetekseen. Tyypin 1 diabetes on krooninen autoimmuunisairaus, jossa immuunisolut tuhoavat haiman insuliinia tuottavat beetasolut. Vaikka haimaperäisten autovasta-aineiden havaitseminen on sairauden varhaisin kliininen merkki, se kertoo myös autoimmuuniprosessin käynnistymisestä haimassa. Koska CD4+ T-solut koordinoivat immuunivasteita, niissä havaitaan tautiin liittyviä muutoksia. On kuitenkin tarpeen ymmärtää ne muutokset, jotka ovat peräisin tietyistä CD4+ T-solualatyypeistä jo ennen autovasta-aineiden ilmaantumista. Tässä väitöskirjassa esitetty työ tarjoaa kattavan ja yksityiskohtaisen analyysin CD4+ T-solualatyyppien yksisolutason transkriptoomista. Tulehdusta edistävä T-solupopulaatio, joka tunnetaan T-auttaja 17 - (Th17) soluina, osallistuu useiden autoimmuunisairauksien patogeneesiin. Näin ollen näitä soluja ja niiden keskeisiä säätelymolekyylejä tutkitaan uusien terapeuttisten lähestymistapojen kehittämiseksi Th17-solujen toiminnan muokkaamiseksi. Väitöskirjassa esitetty työ paljastaa Th17-erilaistumisen uusia säätelijöitä geneettisten ja epigeneettisten mekanismien kautta. Tulokset osoittavat, että sekä FOSL1 että FOSL2 toimivat synergiassa ja kilpailevat sitoutumisesta BATF:n miehittämiin keskeisten Th17-geenien kohtiin ja säätelevät siten erilaistumista. Lisäksi epigeneettiset mekanismit, jotka liittyvät tehostajajaksojen (enhancerien) kautta tapahtuvaan geeniekspression säätelyyn, voivat vaikuttaa Th17-solujen erilaistumiseen. Tulokset osoittavat, että RORA-geenin sisällä sijaitseva tehostaja säätelee Th17-erilaistumista. - Ladataan...Conspiracy Theory Endorsement Profiles: A Cluster Validation StudyMäki, Otto; Marttila, Eetu; Häikiö, Tuomo; Pritup, Daria; Elovaara, Kaisa; Kivioja, Pasi; Kaakinen, Johanna (Wiley)
A substantial body of research has investigated the determinants of conspiratorial beliefs, yet little is known about different conspiracy theory endorsement profiles. The present study used cluster analysis on a set of 52 conspiratorial statements tapping into six conspiracy theory types to identify and validate conspiracy theory endorsement clusters in a randomly drawn sample of the Finnish population (N = 1077). The cluster solution was then further validated in a social media-based convenience sample (N = 772). Four conspiracy theory endorsement clusters with distinct profiles were identified and validated across the samples. Participants who belonged to more conspiracy theory-endorsing clusters held more pseudoscientific beliefs and had lower political trust than participants in the less conspiracy theory-endorsing clusters. Mixed results were found concerning demographic differences. The results provide strong evidence for the existence of four conspiracy theory endorsement profiles and support the notion of a general conspiracy mindset.
- Ladataan...Lessons learned from the safety investigation of an omitted dose-dispensed medicineTiirinki, Hanna; Vuorio, Alpo (Oxford University Press (OUP))
- Ladataan...Kielelliset vaikeudet ovat tunnistettavissa jo 2,5-vuotiaanaSaloranta, Essi (Suomen Terveydenhoitajaliitto STHL ry)