Julkaisuarkisto
Viimeksi lisätyt
- Ladataan...Disrupting immune evasion and metabolic vulnerabilities in myeloid malignancies – A therapeutic perspective on Clever-1
ArtikkeliväitöskirjaYlitalo, Arno
Turun yliopiston julkaisuja - Annales Universitatis Turkuensis, Ser D: Medica, Odontologica : 1973 (Turun yliopisto, 2026-05-29)Relapse and persistence remain major challenges in acute myeloid leukaemia (AML) and myelodysplastic syndromes (MDS). Malignant cells endure not only through clonal genetics but also through support from the marrow niche, where immune restraint and metabolic adaptation coexist. Mitochondrial respiration and lipid utilisation confer survival advantages under therapeutic stress, while intracellular trafficking links immune signalling to mitochondrial metabolism. Clever-1 (STAB1),a scavenger receptor expressed in immunoregulatory myeloid compartments, integrates these processes through endocytic–lysosomal routing. In this PhD thesis, I examine whether Clever-1 functions solely as a niche-level immunoregulatory receptor or also contributes directly to leukaemic cell fitness through cargo routing, mitochondrial lipid handling and bioenergetic adaptation. I characterise Clever-1 expression across malignant myeloid compartments in AML and MDS, spanning immature progenitors and more differentiated myeloid populations, and relate its distribution to differentiation state and immune context. I then investigate cell-intrinsic consequences of Clever-1 targeting. The findings support a role for Clever-1 in endocytic trafficking to mitochondria and selective effects on respiratory organisation. Blockade alters lipoprotein-derived cargo routing, reshapes mitochondrial lipid composition, and reduces respiratory capacity under metabolic constraint, consistent with impaired adaptive flexibility rather than baseline cytotoxicity. To bridge the mechanism with therapeutic relevance, I evaluate antibody-mediated Clever-1 blockade (bexmarilimab) in AML and MDS in ex vivo systems and in an early-phase clinical combination with azacitidine. In this setting, Clever-1 blockade is not primarily a direct cytotoxic therapy but rather a modulator of myeloid state, with target engagement and variable effects shaped by disease context and immune composition. Together, these findings identify Clever-1 as a state-linked trafficking receptor active in both immune and malignant compartments and help define the therapeutic role of Clever-1–directed strategies in AML and MDS.Immuunivasteen vaimentuminen ja metabolinen alttius myelooisissa verisyövissä – Clever-1 terapeuttisesta näkökulmasta Taudin uusiutuminen ja hoitoresistenssi ovat keskeisiä haasteita akuutissa myelooisessa leukemiassa (AML) ja myelodysplastisissa oireyhtymissä (MDS). Pahanlaatuiset solut säilyvät klonaalisen evoluution lisäksi luuytimen mikroympäristön tuella, jossa aineenvaihdunnallinen sopeutuminen ja immuunivasteen vaimeneminen limittyvät. Mitokondrioissa tapahtuva soluhengitys ja lipidien hyödyntäminen tarjoavat leukemiasoluille selviytymisedun hoitopaineen alla, ja solunsisäiset kuljetusreitit kytkevät immuunisäätelyn mitokondrioiden toimintaan. Clever-1 (STAB1) on immuunivastetta muokkaavissa myelooisissa soluissa ilmentyvä haaskareseptori, joka yhdistää nämä prosessit endosyyttisen kierron kautta. Tässä väitöskirjassa tutkin, toimiiko Clever-1 yksinomaan mikroympäristön immuniteetin säätelijänä vai liittyykö se myös leukemiasolujen vastustuskykyyn kuljetusreittien, mitokondrioiden lipidikäsittelyn ja aineenvaihdunnallisen sopeutumisen kautta. Määritän sen ilmentymistä AML- ja MDS-potilaiden soluissa ja suhteutan havainnot taudin kliiniseen ja biologiseen taustaan sekä tutkin Clever-1:n kohdentamisen solunsisäisiä vaikutuksia leukemiasoluissa. Tulokset osoittavat, että Clever-1 osallistuu lipoproteiiniperäisen materiaalin reititykseen mitokondrioihin ja soluhengityksen säätelyyn osana aineenvaihdunnallista sopeutumista. Sen estäminen muuttaa kolesterolin solunsisäistä reititystä, muokkaa mitokondrioiden lipidikoostumusta ja heikentää hengityskapasiteettia aineenvaihdunnallisen kuormituksen aikana, mikä viittaa heikentyneeseen sopeutumiskykyyn eikä suoraan solunjakautumisen estoon. Mekanismin kliinisen merkityksen arvioimiseksi tutkin myös vasta-ainevälitteistä Clever-1-estämistä AML:ssa ja MDS:ssa sekä ex vivo -kokeissa että varhaisvaiheen kliinisessä tutkimuksessa, jossa potilaat saivat yhdistelmähoitoa atsasitidiinin kanssa. Clever-1-estäminen ei näyttäydy ensisijaisesti sytotoksisena hoitona, vaan luuytimen immunologisen tilan kontekstiriippuvaisena säätelijänä. Tulokset osoittavat, että Clever-1 toimii sekä immuuni- että pahanlaatuisissa soluissa ja tarkentaa Clever-1-kohdennettujen hoitojen terapeuttista roolia AML:ssa ja MDS:ssa. - Ladataan...Laser-assisted endodontics: Impact of laser modalities on root canal cleaning, adhesion, and mechanical properties of intraradicular dentin
ArtikkeliväitöskirjaSippus, Jaana
Turun yliopiston julkaisuja - Annales Universitatis Turkuensis, Ser D: Medica,, Odontologica : 1980 (Turun yliopisto, 2026-06-05)Laser-assisted endodontic techniques have emerged as adjuncts to conventional chemo mechanical protocols in Endodontics, aiming to improve root canal cleaning and disinfection. This series of in vitro studies aimed to investigate the effects of laser-assisted endodontic protocols on root canal cleaning, intraradicular bonding and root dentin integrity. The first study evaluated the efficacy of Er:YAG laser using photon-induced photoacoustic streaming (PIPS) and Preciso tips for smear layer removal in root canals. The second study examined whether erbium lasers with modified fiber tips could improve bonding of fiber posts to intraradicular dentin assessing the nano leakage, and pushout bond strength. The third study was assessed the impact of Er:YAG, Er,Cr:YSGG and 940 nm diode lasers on mechanical properties of radicular dentin. Results demonstrated that laser-assisted photoacoustic streaming and Preciso techniques both improved cleaning in the coronal and middle regions of the root canal, while bond strengths were significantly higher at the apical area. Laser irradiation reduced adhesive failures, cement-dentin gap formation, and nano leakage in apical sections, enhancing uniform adhesive bonding interfaces. Although the laser protocols did not significantly affect flexural strength, the highest fatigue strength was observed in erbium treated groups, with endurance limits remaining comparable across protocols.Laser-avusteinen endodontia: Laserin käyttömahdollisuudet juurikanavien puhdistuksessa, sidostamisessa ja intraradikulaari dentiinin mekaanisissa ominaisuuksissa Lasertekniikka on viime aikoina soluttautunut laajasti osaksi perinteistä hammashoitoa. Useat tuoreet tutkimukset ovatkin keskittyneet laserhoitojen mahdollisuuksiin juurihoidoissa varsinkin niiden hyvän desinfektio kyvyn takia. Tämän tutkimussarjan tarkoituksena oli arvioida laserhoidon erityisiä vaikutuksia syväpuhdistuksessa sekä sidostamisessa. Kaikissa erbium-lasereilla tehdyissä juurihoitotutkimuksissa käytettiin fotoakustista tekniikkaa ilman yleisiä biokemiallisia huuhteluaineita. Alkuasetelmana oli juurikanavien syväpuhdistus uusia 360°:n säteilyn mahdollistavia lasikuitu kärkiä hyödyntäen. Seuraava tutkimus keskittyi puhdistavaan vaikutukseen syvemmissä kerroksissa, sekä saumavuodon ja sidoslujuuden analysointiin. Kolmas tutkimus keskittyi rasitustestiin, juurihoitojen usein heikentäessä hampaiden rakennetta, mikrohalkeamia aiheuttaen. Tässä vaiheessa otettiin mukaan myös diodi laser. Kaikki testit tehtiin yleisimpiä juurihoitokärkiä käyttäen erbium lasereilla ja 940 nm diodilla. Fotoakustisella puhdistuksella saadut tulokset osoittivat tilastollisesti merkittäviä eroja juurikanavan ylä- ja keskiosissa, kun taas erbium laserilla aikaansaatu kavitaatio ei tehostanut vaikutusta paljoakaan apikaalisesti. Adheesiota arvioitaessa syväpuhdistuksen jälkeen havaittavat sidoslujuudet olivat merkittävästi korkeampia juuren kärjen läheisyydessä. Lasersäteily voi vähentää sidosongelmia sementin ja dentiinin rajapinnoilla, sekä saumavuotoa kärkialueella. Kaikki laserprotokollat, joissa käytetään uuden mallisia juurihoitokärkiä, voivat merkittävästi parantaa dentiinin, hartsin ja lasikuitunastojen välisiä sidosrajapintoja. Laserprotokollat eivät saavuttaneet merkittävää vaikutusta taivutuslujuuteen. Kuitenkin parhaimmat voimat esiintyivät erbium-käsitellyissä ryhmissä. Myös huippukestävyysrajat nousivat samoin, ollen selkeästi kontrolliryhmiä parempia. - Ladataan...Rapid-Response Characterization of Near-Earth Asteroid 2024 YR4 During a Torino Scale 3 AlertDevogèle, Maxime; Hainaut, Olivier R.; Micheli, Marco; Pravec, Petr; Cano, Juan Luis; Ocaña, Francisco; Conversi, Luca; Moskovitz, Nicholas; de León, Julia; Gray, Zuri; Granvik, Mikael; Fedorets, Grigori; de Micas; Jules Bourdelle; Ieva, Simone; Dotto, Elisabetta; Beuden, Tracie; Fuls, Carson; Kareta, Theodore; Bagnulo, Stefano; Barucci, Maria Antonella; Birlan, Mirel; Farina, Andrea; Hornoch, Kamil; Fatka, Petr; Kušnirák, Peter; Ferri, Francesca; Fulchignoni, Marcello; Lazzarin, Monica; La Forgia, Fiorangela; Epifani, Elena Mazzotta; Mura, Alessandra; Perna, Davide; Bendjoya, Philippe; Rivet, Jean-Pierre; Cellino, Alberto (Springer Science and Business Media LLC)On 27 December 2024, near-Earth object (NEO) 2024 was discovered by the ATLAS survey and identified as a virtual impactor. A few weeks later, it eventually reached level 3 on the Torino Scale and was the first and only asteroid to be ever classified at that level. Here we report an intensive observational campaign combining time-series photometry in the visible, broadband visible and near-infrared colors, and low-resolution visible reflectance spectroscopy to assess its physical properties. Fourier analysis of the lightcurves yields a synodic rotation period of min, placing 2024 among the fast rotators, even if such rotation is common for objects of similar H magnitude. Its visible and near-infrared colors and spectra are most consistent with an Sq or K taxonomic classification, though some ambiguity remains. Finally, its phase curve exhibits a notably shallow slope (), from which we derive an absolute magnitude of mag. After color correction and taking into account other models for the phase function, we report an absolute magnitude of mag. These characterizations, rotation period, taxonomy, and surface properties, would have been crucial for risk assessment and mitigation planning had the initially high impact probability scenario been confirmed, underscoring the importance for planetary defense of a rapid, coordinated international response.
- Ladataan...From the Reality–Virtuality Continuum to the XR Ecosystem: A Systematic Literature Review of Definitions and Conceptual ModelsHan, Xiaoran; Lehtonen, Teijo; Mäkilä, Tuomas (MDPI AG)
Extended Reality (XR) technologies are rapidly reshaping human–computer interaction; however, persistent ambiguity in the use of core terms (VR, AR, MR) hampers cumulative knowledge building, cross-study comparability, and technical standardisation. This review evaluates the XR conceptual landscape across four primary dimensions: the historical evolution of core definitions, the synthesis of contemporary theoretical frameworks, the critical extensions of the Reality-Virtuality (RV) Continuum, and the alignment between academic taxonomies and industry practices. This review evaluates the XR conceptual landscape across four primary dimensions: the historical evolution of core definitions, the synthesis of contemporary theoretical frameworks, the critical extensions of the Reality-Virtuality (RV) Continuum, and the alignment between academic taxonomies and industry practices. To address this issue, we conducted a PRISMA-guided systematic literature review across four major databases (IEEE Xplore, ACM Digital Library, Scopus, and Web of Science), complemented by seminal and industry sources. Of the 173,677 retrieved records, 59 studies were included in the synthesis. Using thematic synthesis, we mapped the historical evolution of definitions and conceptual models and identified recurring analytical dimensions. The results indicate a clear paradigm shift from Milgram’s one-dimensional Reality–Virtuality continuum—originally grounded in visual display technology—towards a multidimensional conceptual space that integrates subjective user-experience constructs (e.g., coherence and plausibility) with objective system characteristics. The included studies cover 1968–2025, with marked acceleration in the 2020s: 2022 alone accounts for the highest annual count (9 studies), and nearly half of the corpus (47.5%) was published in 2021–2025. We further show that industry actors pragmatically re-bound these academic concepts for product and market positioning, leading to systematic divergences between academic and industrial definitions. By distilling key turning points and synthesising core analytical dimensions into a structured lens, this review provides a historically grounded, actionable understanding of the XR conceptual landscape to support terminological alignment across research and practice.
- Ladataan...Generative AI in Participatory Urban Planning: Synthetic Inhabitants and ExpertsJauhiainen, Jussi; Hakanpää, Sanni; Honkasaari, Heikki-Pekka; Kivilompolo, Niilas; Kurri, Matias; Lehtiranta, Luukas; Nurminen, Mirva (MDPI AG)
Generative AI (GenAI) is increasingly applied in urban planning for text production, visualization, analytics, stakeholder communication, and participatory engagement. Large language models (LLMs) enable the creation of synthetic participants to support the early-stage design, analysis, and testing of participatory tools. This article demonstrates an innovative use of GenAI through synthetic inhabitants and experts in an immersive digital urban planning environment. DigitalTurku serves as a proof-of-concept for an immersive planning tool within an urban digital twin. The case relies on synthetic personas—residents and expert stakeholders—to evaluate how a GenAI-assisted urban platform may shape participation experiences and trust in local urban planning. The findings indicate that synthetic experts expressed a reduced bureaucratic distance, enhanced transparency, and more meaningful participation. However, assessments of tools and digital environment usability varied according to digital skills and demographic characteristics embedded in the personas. The use of synthetic personas helps identify opportunities and challenges in immersive urban planning environments and supports the design of digital tools in smart cities to strengthen human residents’ spatial understanding and experiential engagement in planning processes. The creation of synthetic data and participants is convenient with LLMs. Despite these tools’ limitations, they can play a valuable role in piloting participatory planning processes to support and complement human-based participation.