Sarkoidoositietokanta
Lahti, Jari (2018-11-28)
Sarkoidoositietokanta
(28.11.2018)
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
suljettu
Julkaisun pysyvä osoite on:
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe201902225978
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe201902225978
Tiivistelmä
Työssä toteutettiin tietokanta ja sen graafinen käyttöliittymä sarkoidoositutkimusta varten. Työn perusteella sarkoidoositutkija saa käsityksen käytetystä aineistosta ja tiedonkeruumenetelmistä, alustavista tuloksista sekä tarvittavat tiedot tutkimuksen jatkamista varten. Motivaatio työhön oli tuottaa ajantasaista tietoa sarkoidoosista Varsinais-Suomen sairaanhoitopiirille (VSSHP) suunnittelun pohjaksi.
Aineisto koostui VSSHP:n alueella sarkoidoosidiagnoosin vuosina 2004–2014 saaneista potilaista. Tietoja kerättiin tietokantaan kaksivaiheisesti. Ensimmäisessä, automatisoidussa vaiheessa, hyödynnettiin VSSHP:n Auria tietopalvelua (ATP) ja jälkimmäisessä vaiheessa tietokannan tietoja täydennettiin manuaalisesti potilastekstejä läpi käymällä.
Työn tuloksena syntyi tietokanta, johon diagnoosikoodien perusteella tunnistettiin 1390 potilaan kohortti, joista 714 kpl (51 %) oli naisia ja 676 kpl (49 %) oli miehiä. Tietokanta sisältää automatisoidusti kerätyt tiedot kohortin potilaiden diagnosoinnista,
laboratoriokokeista, kuvantamisesta, kudosnäytteistä, hoidosta, seurannasta sekä oheissairastavuudesta. Manuaalisesti läpikäydyn 229:n potilaan muodostaman otoksen (16 % kohortista) perusteella vain 45 % kohortin potilaista on saanut sarkoidoosin ensidiagnoosin ym. ajanjaksolla ja täten koko kohortin potilastekstien läpikäynti on tarpeen ennen tietokannan soveltuvuutta tutkimuskäyttöön.
Aineisto koostui VSSHP:n alueella sarkoidoosidiagnoosin vuosina 2004–2014 saaneista potilaista. Tietoja kerättiin tietokantaan kaksivaiheisesti. Ensimmäisessä, automatisoidussa vaiheessa, hyödynnettiin VSSHP:n Auria tietopalvelua (ATP) ja jälkimmäisessä vaiheessa tietokannan tietoja täydennettiin manuaalisesti potilastekstejä läpi käymällä.
Työn tuloksena syntyi tietokanta, johon diagnoosikoodien perusteella tunnistettiin 1390 potilaan kohortti, joista 714 kpl (51 %) oli naisia ja 676 kpl (49 %) oli miehiä. Tietokanta sisältää automatisoidusti kerätyt tiedot kohortin potilaiden diagnosoinnista,
laboratoriokokeista, kuvantamisesta, kudosnäytteistä, hoidosta, seurannasta sekä oheissairastavuudesta. Manuaalisesti läpikäydyn 229:n potilaan muodostaman otoksen (16 % kohortista) perusteella vain 45 % kohortin potilaista on saanut sarkoidoosin ensidiagnoosin ym. ajanjaksolla ja täten koko kohortin potilastekstien läpikäynti on tarpeen ennen tietokannan soveltuvuutta tutkimuskäyttöön.