MALDI-TOF-massaspektrometria kliinisessä mikrobiologiassa

Abstract

Kuluvan vuosikymmenen aikana MALDI-TOF-massaspektrometria (matrix-assisted laser-desorption ionization time-of-flight) on mahdollistanut taudinaiheuttajabakteerien ja -sienten tunnistamisen huomattavasti nopeammin ja luotettavammin kuin biokemiallisilla menetelmillä. Kun bakteerien tunnistus biokemiallisia menetelmiä käyttäen saattaa viedä useita vuorokausia, MALDI-TOF-massaspektrometrialla tunnistus viljelymaljalla kasvavasta pesäkkeestä voidaan tehdä muutamassa minuutissa tai positiivisesta veriviljelypullosta parissakymmenessä minuutissa. Näin kliinisen mikrobiologian laboratorio pystyy antamaan bakteeriviljelyistä tunnistustuloksen hoitavalle yksikölle heti, kun viljelymaljoilla tai veriviljelypulloissa havaitaan kasvua. MALDI-TOF-massaspektrometrian merkittävimpänä rajoituksena on se, että se vaatii edeltävän malja- tai rikastusviljelyn. Lisäksi toisilleen poikkeuksellisen läheistä sukua olevat bakteerit kuten Escherichia coli ja Shigella, jotka eivät erotu toisistaan bakteeritunnistuksessa usein referenssimenetelmänä käytetyllä 16S rRNA -sekvensoinnilla, ovat vaikeita tunnistettavia myös MALDI-TOF-massaspektrometrialla.