Hyppää sisältöön
    • Suomeksi
    • In English
  • Suomeksi
  • In English
  • Kirjaudu
Näytä aineisto 
  •   Etusivu
  • 3. UTUCris-artikkelit
  • Rinnakkaistallenteet
  • Näytä aineisto
  •   Etusivu
  • 3. UTUCris-artikkelit
  • Rinnakkaistallenteet
  • Näytä aineisto
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Lineage-specific variations in the trigger loop modulate RNA proofreading by bacterial RNA polymerases

Turtola M; Belogurov G; Kulbachinskiy A; Esyunina D; Pupov D; Bass I; Klimašauskas S

Lineage-specific variations in the trigger loop modulate RNA proofreading by bacterial RNA polymerases

Turtola M
Belogurov G
Kulbachinskiy A
Esyunina D
Pupov D
Bass I
Klimašauskas S
Katso/Avaa
Nucl. Acids Res.-2016-Esyunina-1298-308.pdf (2.390Mb)
Lataukset: 

Oxford Univ Press
doi:10.1093/nar/gkv1521
URI
http://nar.oxfordjournals.org/content/44/3/1298
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on:
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2021042715274
Tiivistelmä


RNA cleavage by bacterial RNA polymerase (RNAP) has been implicated in transcriptional proofreading and reactivation of arrested transcription elongation complexes but its molecular mechanism is less understood than the mechanism of nucleotide addition, despite both reactions taking place in the same active site. RNAP from the radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans is characterized by highly efficient intrinsic RNA cleavage in comparison with Escherichia coli RNAP. We find that the enhanced RNA cleavage activity largely derives from amino acid substitutions in the trigger loop (TL), a mobile element of the active site involved in various RNAP activities. The differences in RNA cleavage between these RNAPs disappear when the TL is deleted, or in the presence of GreA cleavage factors, which replace the TL in the active site. We propose that the TL substitutions modulate the RNA cleavage activity by altering the TL folding and its contacts with substrate RNA and that the resulting differences in transcriptional proofreading may play a role in bacterial stress adaptation.

Kokoelmat
  • Rinnakkaistallenteet [19207]

Turun yliopiston kirjasto | Turun yliopisto
julkaisut@utu.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste
 

 

Tämä kokoelma

JulkaisuajatTekijätNimekkeetAsiasanatTiedekuntaLaitosOppiaineYhteisöt ja kokoelmat

Omat tiedot

Kirjaudu sisäänRekisteröidy

Turun yliopiston kirjasto | Turun yliopisto
julkaisut@utu.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste