Hyppää sisältöön
    • Suomeksi
    • In English
  • Suomeksi
  • In English
  • Kirjaudu
Näytä aineisto 
  •   Etusivu
  • 3. UTUCris-artikkelit
  • Rinnakkaistallenteet
  • Näytä aineisto
  •   Etusivu
  • 3. UTUCris-artikkelit
  • Rinnakkaistallenteet
  • Näytä aineisto
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Metabolic Modeling of Human Gut Microbiota on a Genome Scale: An Overview

Partho Sen; Matej Orešič

Metabolic Modeling of Human Gut Microbiota on a Genome Scale: An Overview

Partho Sen
Matej Orešič
Katso/Avaa
Publisher's PDF (889.8Kb)
Lataukset: 

doi:10.3390/metabo9020022
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on:
https://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2021042612398
Tiivistelmä
There is growing interest in the metabolic interplay between the gut microbiome and host metabolism. Taxonomic and functional profiling of the gut microbiome by next-generation sequencing (NGS) has unveiled substantial richness and diversity. However, the mechanisms underlying interactions between diet, gut microbiome and host metabolism are still poorly understood. Genome-scale metabolic modeling (GSMM) is an emerging approach that has been increasingly applied to infer diet⁻microbiome, microbe⁻microbe and host⁻microbe interactions under physiological conditions. GSMM can, for example, be applied to estimate the metabolic capabilities of microbes in the gut. Here, we discuss how meta-omics datasets such as shotgun metagenomics, can be processed and integrated to develop large-scale, condition-specific, personalized microbiota models in healthy and disease states. Furthermore, we summarize various tools and resources available for metagenomic data processing and GSMM, highlighting the experimental approaches needed to validate the model predictions.
Kokoelmat
  • Rinnakkaistallenteet [19207]

Turun yliopiston kirjasto | Turun yliopisto
julkaisut@utu.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste
 

 

Tämä kokoelma

JulkaisuajatTekijätNimekkeetAsiasanatTiedekuntaLaitosOppiaineYhteisöt ja kokoelmat

Omat tiedot

Kirjaudu sisäänRekisteröidy

Turun yliopiston kirjasto | Turun yliopisto
julkaisut@utu.fi | Tietosuoja | Saavutettavuusseloste