Vaihtoehtoiset 5´-suojaryhmät oligonukleotidisynteesissä
842.64 KB
avoin
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Lataukset118
Pysyvä osoite
Verkkojulkaisu
DOI
Tiivistelmä
Tavallisesti oligonukleotidit syntetisoidaan kiinteällä kantajalla käyttäen fosforamidiittimenetelmää. 5´-Hydroksyyliryhmän suojauksessa yleisimmin käytetty suojaryhmä on 4,4´-dimetoksitrityyli (DMTr). Terapeuttisten oligonukleotidien kasvava kysyntä asettaa haasteita oligonukleotidien valmistukselle. Kustannustehokkaampia, ympäristöystävällisempiä ja suuremman mittakaavan synteesimenetelmiä tarvitaan.
Vaihtoehdon dimetoksitrityylille tarjoaa asetaalisuojaryhmät, joita on käytetty syntetisoitaessa oligonukleotideja liukoisella kantajalla. DMTr-ryhmän irtoaminen liuoksessa on reversiibeli prosessi, jolloin trityyli ei välttämättä ole optimaalinen valinta 5´-hydroksyyliryhmän suojaryhmäksi. Asetaalisuojaryhmien, 2-metoksiprop-2-yylin (MIP) ja 2-isopropoksiprop-2-yylin (IIP), irtoaminen tapahtuu pseudo-irreversiibelisti, jonka takia ne soveltuvat hyvin liuosfaasisynteesiin. Sivutuotteena muodostuu haihtuvia tuotteita kuten asetonia ja metanolia tai isopropanolia. Asetaalisuojaryhmät irtoavat myös huomattavasti nopeammin verrattuna dimetoksitrityyliin.
Myös piksyyli- ja fotolabiileja suojaryhmiä on käytetty 5´-suojaryhminä. Piksyyliryhmä on happolabiilimpi kuin dimetoksitrityyli, ja sen happolabiilisuutta pystytään säätelemään liittämällä 9-fenyylirenkaaseen erilaisia substituentteja. Lisäksi piksyylisuojaryhmillä suojatut nukleosidit kiteytyvät paremmin kuin dimetoksitrityylillä suojatut nukleosidit. Fotolabiilit suojaryhmät voidaan irrottaa sopivan aallonpituuden valolla, ja ne ovat osoittautuneet käyttökelpoiseksi valinnaksi oligonukleotidimikrosirujen synteesissä.
LuK-tutkielmassa käsitellään 5´-hydroksyyliryhmän suojausmenetelmiä ja esitetään suojaryhmien irrottamiseen käytettyjä olosuhteita oligonukleotidisyntetiikassa.