Nielutulehduksia aiheuttaneiden A-streptokokkien emm-tyypit Varsinais-Suomessa

Tietueen suppeat tiedot
dc.contributor.authorVirolainen, Mirva
dc.contributor.departmentfi=Biolääketieteen laitos|en=Institute of Biomedicine|
dc.contributor.facultyfi=Lääketieteellinen tiedekunta|en=Faculty of Medicine|
dc.contributor.studysubjectfi=Lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia|en=Medical Microbiology and Immunology|
dc.date.accessioned2019-01-11T22:00:23Z
dc.date.available2019-01-11T22:00:23Z
dc.date.issued2018-10-24
dc.description.abstractStreptococcus pyogenes eli A-streptokokki (GAS, Group A Streptococcus) on kokkibakteeri, joka on merkittävä ihmisen taudinaiheuttaja. Sen aiheuttamien infektioiden vakavuusasteet vaihtelevat lievistä nielutulehduksista aina henkeä uhkaaviin invasiivisiin tautimuotoihin, kuten bakteremiaan, asti. Yleisin GAS:n aiheuttama tautimuoto on nielutulehdus, ja sairastavuus siihen on suurta ympäri maailman. GAS-nielutulehdukset aiheuttavat runsaasti kustannuksia, minkä lisäksi ne ovat aina riski invasiivisen infektion kehittymiselle. GAS-infektioiden epidemiologisessa tutkimuksessa käytetään usein emm-tyypitystä, joka perustuu bakteerin tärkeän virulenssitekijän, M-proteiinin, geenin sekvenssin määrittämiseen. emm-tyyppijakaumia on tutkittu paljon invasiivisista infektioista, mutta nielutulehduksista tutkimustuloksia on vähemmän. Tässä syventävien opintojen työssä tutkittiin Varsinais-Suomen sairaanhoitopiirissä eristettyjen GAS-nielutulehduskantojen emm-tyyppijakaumia. Lisäksi selvitettiin nielutulehdusta sairastaneiden potilaiden ikä- ja sukupuolijakaumia. Tutkimukseen kerättiin kaikki Tyks kliinisen mikrobiologian osaston GAS-nielutulehduskannat helmi-maaliskuussa ja syys-lokakuussa 2017. Kantojen oikeellisuus varmistettiin kaupallisella agglutinaatiotestillä. Kaikille kannoille tehtiin emm-tyypitys käyttämällä High Resolution Melting (HRM) -menetelmää, joka tunnisti viisi emm-tyyppiä. HRM-menetelmän toimivuus varmistettiin ja menetelmällä negatiiviseksi jääneet kannat sekvensoitiin. GAS-nielutulehduskantoja kerättiin yhteensä 357. Löydöksiä oli eniten ikäryhmässä 5-9 vuotta (23 % kaikista tapauksista). Miehillä löydöksiä oli eniten ikäryhmissä 0-9 vuotta ja naisilla 20-24 vuotta sekä 30-34 vuotta. Eri emm-tyyppejä löydettiin 19. Yleisimmät olivat emm89, emm12, emm28 ja emm1 (81 % tapauksista). Samojen emm¬-tyyppien tiedetään olevan yleisimpiä myös invasiivisissa GAS-infektioissa Suomessa. emm12 havaittiin yleisemmäksi keväällä ja emm89 syksyllä. Alle 5-vuotiailla emm12 ja 20-24-vuotiailla muut kuin tutkimuksen neljä yleisintä emm-tyyppiä havaittiin olevan yleisimpiä.
dc.format.extent52
dc.identifier.olddbid163415
dc.identifier.oldhandle10024/146603
dc.identifier.urihttps://www.utupub.fi/handle/11111/20418
dc.identifier.urnURN:NBN:fi-fe201901112001
dc.language.isofin
dc.rightsfi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.|
dc.rights.accessrightssuljettu
dc.source.identifierhttps://www.utupub.fi/handle/10024/146603
dc.subjectStreptococcus pyogenes, A-ryhmän streptokokki, emm-tyypitys
dc.titleNielutulehduksia aiheuttaneiden A-streptokokkien emm-tyypit Varsinais-Suomessa
dc.type.ontasotfi=Syventävien opintojen kirjallinen työ|en=Second Cycle degree thesis|

Tiedostot

Näytetään 1 - 1 / 1
Name:
Virolainen_Mirva_opinnayte.pdf
Size:
992.47 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Lataa

Kokoelmat

Pro gradu -tutkielmat ja diplomityöt sekä syventävien opintojen opinnäytetyöt (rajattu näkyvyys)