Uudet fuusiogeenit huonosti erilaistuneessa seroosissa munasarjasyövässä (HGSOC)

Tietueen suppeat tiedot
dc.contributor.authorKähkönen, Tiia
dc.contributor.departmentfi=Biologian laitos|en=Department of Biology|
dc.contributor.facultyfi=Luonnontieteiden ja tekniikan tiedekunta|en=Faculty of Science and Engineering|
dc.contributor.studysubjectfi=Fysiologia ja genetiikka|en=Physiology and Genetics|
dc.date.accessioned2020-08-15T21:00:49Z
dc.date.available2020-08-15T21:00:49Z
dc.date.issued2020-05-22
dc.description.abstractMunasarjasyövän yleisin ja tappavin alatyyppi on huonosti erilaistunut seroosi munasarjasyöpä (HGSOC), joka ehtii levitä usein laajalle alueelle ennen taudin diagnosointia. HGSOC-munasarjasyövälle on tyypillistä taudin heterogeenisyys, poikkeuksellinen geneettinen epävakaus ja kromosomimutaatioiden runsas määrä. Kun kaksi aiemmin erillään ollutta geeniä yhdistyy esimerkiksi kromosomin translokaation tai häviämän seurauksena, syntyy fuusiogeeni. Pro gradu -työssäni keskityin varmistamaan uusien fuusiogeenien ilmenemistä ja fuusioproteiinien esiintymistä potilaiden kasvainnäytteissä. Fuusioproteiinien ilmenemisaste, toiminta ja rakenne on yleensä muuttunut fuusion seurauksena, mikä puolestaan voi johtaa syöpäsolujen kiihtyneeseen jakautumiseen. Kolmea potentiaalisinta fuusiota tutkittiin lisäksi solutasolla ylituottamalla fuusioproteiineja syöpäsoluissa. Fuusiogeenien AKT2-PBX4, AKT2-ZNF546, CDH2-INO80C ja PIK3R1-CCDC178 havaitseminen RT-qPCR- ja RNA ISH -menetelmillä varmisti tutkittujen fuusiogeenien olevan todellisia ja niiden ilmenevän kudoksissa mRNA:ksi. Pro gradu -työssä tutkittiin, tuotetaanko kasvaimissa ilmenevistä fuusiogeeneistä fuusioproteiineja, jotka ovat potentiaalisesti merkittäviä munasarjasyövän patogeneesissä. Vaikka fuusioproteiineja ei pystytty osoittamaan kasvainkudoksissa Western blot -menetelmällä tässä tutkimuksessa, niiden mahdollista muodostumista ei voida kuitenkaan poissulkea. Ylituotettujen fuusioproteiinien tarkastelu immunofluoresenssivärjäyksillä havainnollisti niiden rakennetta ja sijaintia syöpäsoluissa. Lisäksi ylituotetun PIK3R1-CCDC178-fuusioproteiinin havaittiin muodostavan yllättäviä rakenteita solujen sytoplasmassa. HGSOC-munasarjasyöpään tarvitaan uusia vaihtoehtoisia hoitomuotoja, sillä taudille kehittyy usein vastustuskyky olemassa olevalle hoidolle. Kolme tutkittavista fuusioista liittyy munasarjasyövässä hyperaktiiviseen PI3K-AKT-mTOR-signalointireittiin, mikä voi mahdollistaa esimerkiksi fuusioihin kohdistettujen uusien hoitomuotojen kehittämisen. Työssäni luomia solulinjoja tullaan käyttämään tutkimusryhmän jatkotutkimuksissa, joissa tarkastellaan fuusioiden toiminnallisia vaikutuksia, sekä pohditaan fuusioiden mahdollisuutta toimia lääkeainekohteina ja diagnostisina biomarkkereina HGSOC-munasarjasyövässä.
dc.format.extent77
dc.identifier.olddbid167111
dc.identifier.oldhandle10024/150240
dc.identifier.urihttps://www.utupub.fi/handle/11111/21738
dc.identifier.urnURN:NBN:fi-fe2020081560582
dc.language.isofin
dc.rightsfi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.|
dc.rights.accessrightssuljettu
dc.source.identifierhttps://www.utupub.fi/handle/10024/150240
dc.subjectmunasarjasyöpä, HGSOC, fuusiogeeni, fuusioproteiini
dc.titleUudet fuusiogeenit huonosti erilaistuneessa seroosissa munasarjasyövässä (HGSOC)
dc.type.ontasotfi=Pro gradu -tutkielma|en=Master's thesis|

Tiedostot

Näytetään 1 - 1 / 1
Name:
Kahkonen_Tiia_opinnayte.pdf
Size:
2.49 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Lataa

Kokoelmat

Pro gradu -tutkielmat ja diplomityöt sekä syventävien opintojen opinnäytetyöt (rajattu näkyvyys)