Sokeriosasta modifioidut nukleosiditrifosfaatit ja niiden käyttö bakteerien elintoimintojen tutkimuksessa

dc.contributor.authorMäkelä, Janica
dc.contributor.departmentfi=Kemian laitos|en=Department of Chemistry|
dc.contributor.facultyfi=Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta|en=Faculty of Science|
dc.contributor.studysubjectfi=Kemia|en=Chemistry|
dc.date.accessioned2025-05-14T21:30:26Z
dc.date.available2025-05-14T21:30:26Z
dc.date.issued2025-05-12
dc.description.abstractNukleosiditrifosfaatit (NTP) ovat kaikilla eliöillä luonnollisesti esiintyviä molekyylejä. NTP:t ja deoksinukleosiditrifosfaatit eli dNTP:t toimivat RNA:n ja DNA:n rakennusyksiköinä. Tässä tutkielmassa keskitytään sokerimodifioituihin eli synteettisiin NTP:ihin. Sokerimodifikaatioihin kuuluvat mm. heteroatomien tai funktionaalisten ryhmien lisääminen sokerirenkaaseen sekä erilaiset silloittuneet rengasrakenteet. Modifioitujen NTP:iden sovelluskohteisiin kuuluvat mm. antisense- ja antigeenioligonukleotidien kehittäminen, antiviraalit nukleosidianalogit ja oligonukleotidien leimaus. Lisäksi puhutaan geneettisen ”aakkoston” laajentamisesta, eli keinotekoisten NTP:iden sisällyttämisestä DNA:han tai RNA:han. Johdannossa esitetään lyhyesti esimerkit näistä sovelluksista. Ensimmäinen NTP:iden kemiallinen synteesi raportoitiin vuonna 1949. NTP:iden synteesissä lähtöaineena käytetään tavallisesti nukleosidimonofosfaattia, joka fosforyloidaan erilaisten menetelmien avulla. Synteesin tavanomainen ongelma on 5’-hydroksiryhmän selektiivinen fosforylaatio. Tutkielmassa tutustutaan erilaisiin synteesimenetelmiin, jonka avulla tätä ongelmaa on voitu ratkaista. Tutkielmassa tarkastellaan, kuinka erilaiset sokerimodifioidut NTP:t toimivat sekä luonnollisten, että modifioitujen, eli evoluutiivisesti ohjattujen polymeraasien substraatteina. Sokerimodifioidut NTP:t vaikuttavat merkittävästi bakteerien polymeraasien entsymaattiseen aktiivisuuteen. Tästä johtuen tutkimus on keskittynyt polymeraasien ohjattuun evoluutioon, jonka ansioista :itä voidaan tunnistaa ja käyttää eri polymeraasien substraatteina DNA- ja XNA -synteesiä, replikaatiota ja käänteistranskriptiota varten. Tutkielman lopussa tarkastellaan sokerimodifioituja XNA:ita.
dc.format.extent21
dc.identifier.olddbid198149
dc.identifier.oldhandle10024/181187
dc.identifier.urihttps://www.utupub.fi/handle/11111/2683
dc.identifier.urnURN:NBN:fi-fe2025051444367
dc.language.isofin
dc.rightsfi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.|
dc.rights.accessrightsavoin
dc.source.identifierhttps://www.utupub.fi/handle/10024/181187
dc.subjectnukleosiditrifosfaatti, nukleosidi analogi, sokerimodifikaatio
dc.titleSokeriosasta modifioidut nukleosiditrifosfaatit ja niiden käyttö bakteerien elintoimintojen tutkimuksessa
dc.type.ontasotfi=Kandidaatintutkielma|en=Bachelor's thesis|

Tiedostot

Näytetään 1 - 1 / 1
Ladataan...
Name:
Tutkielma%20JM%2011.5.%20PDF.pdf
Size:
715 KB
Format:
Adobe Portable Document Format