Organoelohopea-aptameerit LA-ICP-MS-merkkiaineina

Tietueen suppeat tiedot
dc.contributor.authorSarin, Ida
dc.contributor.departmentfi=Kemian laitos|en=Department of Chemistry|
dc.contributor.facultyfi=Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta|en=Faculty of Science|
dc.contributor.studysubjectfi=Kemia|en=Chemistry|
dc.date.accessioned2024-08-03T21:02:15Z
dc.date.available2024-08-03T21:02:15Z
dc.date.issued2024-07-22
dc.description.abstractAptameerit ovat yksijuosteisia DNA- ja RNA-molekyylejä, joilla on kyky sitoutua lujasti kohteeseensa. Sitoutumisominaisuuksiensa vuoksi aptameerit ovat kiinnostava kohde erilaisiin lääkekehityksen sovelluksiin. Aptameerit valmistetaan SELEX-menetelmällä ja niiden ominaisuuksia voidaan muokata monin eri tavoin. LA-ICP-MS-kuvantaminen (eng. Laser inductively coupled plasma mass spectrometry) on menetelmä, jolla voidaan kuvantaa alkuaineiden jakautumista kiinteissä näytteissä. Menetelmässä näytettä käsitellään korkeaenergisellä lasersäteellä. Laser irrottaa näytteestä hiukkasia, jotka kuljetetaan eteenpäin ionisoitavaksi ICP:lle ja siitä eteenpäin analysoitavaksi MS-laitteistolle. Analyysin pohjalta voidaan muodostaa korkearesoluutioisia karttoja näytteen alkuainekoostumuksista. Tämän työn tarkoituksena oli valmistaa organoelohopealeimattu aptameeri ja soveltaa sitä LA-ICP-MS-kuvantamisessa. Aptameeriksi valikoitui tunnettu aptameeri, jonka kohteena on syöpäsolun pintaproteiinit. Organoelohopealeima olisi mahdollista havaita LA-ICP-MS-menetelmällä. Jos tällainen leima olisi kiinnitettynä aptameeriin olisi mahdollista paikantaa aptameeri ja näin ollen myös aptameerin kohde. Aptameerit valmistettiin kiinteän kantajan menetelmällä automaattisella DNA/RNA- syntetisaattorilla. Syntetisoituun aptameeriin konjugoitiin linkkerin välityksellä organoelohopea-aldehydi. Organoelohopea-aldehydin liittämisessä hyödynnettiin vakiintunutta oksimaatioreaktiota. Aptameerien HPLC-puhdistuksessa oli haasteita mutta oikeanlaisen kolonnin avulla puhdistus onnistuttiin suorittamaan. Aptameerit karakterisoitiin massaspektrometrisesti. Valmistetun organoelohopea-aptameerin detektioraja määritettiin LA-ICP-MS menetelmällä käyttäen matriisina hiiren aivokudosta. Mittausten perusteella todettiin, että jo 5 nM laimennoksella saadaan selkeästi taustasta erottuva signaali elohopeasta.
dc.format.extent44
dc.identifier.olddbid195792
dc.identifier.oldhandle10024/178843
dc.identifier.urihttps://www.utupub.fi/handle/11111/16845
dc.identifier.urnURN:NBN:fi-fe2024080263274
dc.language.isofin
dc.rightsfi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.|
dc.rights.accessrightsavoin
dc.source.identifierhttps://www.utupub.fi/handle/10024/178843
dc.subjectOligonukleotidi, Aptameeri, Organoelohopea, LA-ICP-MS
dc.titleOrganoelohopea-aptameerit LA-ICP-MS-merkkiaineina
dc.type.ontasotfi=Pro gradu -tutkielma|en=Master's thesis|

Tiedostot

Näytetään 1 - 1 / 1
Name:
Sarin_Ida_opinnayte.pdf
Size:
2.16 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Lataa

Kokoelmat

Pro gradu -tutkielmat ja diplomityöt sekä syventävien opintojen opinnäytetyöt (kokotekstit)