σ-faktoreiden ylituotto syanobakteerissa Synechocystis sp. PCC 6803

Ladataan...
suljettu
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Lataukset1

Verkkojulkaisu

DOI

Tiivistelmä

Biotuotannossa käytettävät bakteerikannat hyötyvät parantuneesta stressinsietokyvystä. Tässä tutkimuksessa syanobakteerin stressinsietoa yritetään parantaa muuttamalla RNApolymeraasin toimintaa. Syanobakteerien RNA-polymeraasin holoentsyymi koostuu kuudesta ytimen alayksiköstä sekä sigmafaktorista, joka tunnistaa promoottorin ja mahdollistaa transkription aloituksen. Kasvun aikana välttämätön SigA-faktori tunnistaa taloudenpitogeenit ja sen määrän muutokset voivat vaikuttaa kasvunopeuteen. Ryhmän 2 sigmafaktorit SigB, SigC, SigD ja SigE eivät ole välttämättömiä optimiolosuhteissa, mutta tunnistavat stressiolosuhteiden sietoon ja sopeutumiseen liittyviä geenejä. Synechocystiksen sigA ja sigB-geenit kloonattiin vahvan, valossa indusoituvan psbA2-promootterin alaisuuteen ja siirrettiin antibioottiresistenssikasetin ohella korvaamaan joko psbA2- tai psbA1-geeni genomista. Valikoituneet linjat todennettiin sekvensoimalla. Kvantitatiivisen PCR:n avulla sigA:n lähetti-RNA:n määrän todettiin lisääntyneen kolminkertaiseksi ja sigB:n lähetti-RNA:n määrän nelinkertaiseksi ylituottokannoissa. Kummankaan kannan kasvussa ei huomattu eroa villityypin Synechocystikseen standardiolosuhteissa tai kirkkaassa valossa. SigB:n ylituotto paransi Synechocystiksen sietokykyä butanolille, kuumalle ja reaktiivisille happiyhdisteille. Butanolin haitallisuuden ajatellaan ainakin osittain johtuvan sen aiheuttamasta hapettavasta stressistä. SigB-oe kannan toleranssi sekä metyleenisinisen tuottamalle singlettihapelle että metyleeniviologeenilla tuotetulle superoksidille oli parempaa kuin villityypin soluilla. SigB-ylituottokanta sisälsi kontrollikantaa enemmän karotenoideja sekä standardioloissa että superoksidistressissä. SigB:n tiedetään lisäävän karotenoidien lisäksi myös kaperoniproteiinien tuottoa, joista molemmat suojaavat solua hapettavilta reaktioilta. SigB-oe-kannan parantuneesta hapettavien yhdisteiden ja butanolin kestävyydestä on hyötyä muun muassa jäteveden puhdistuksessa sekä kemikaalien biologisessa tuotannossa.

item.page.okmtext