DNA-metylaatioon perustuvat bakteerien puolustusjärjestelmät ja virusten keinot niiden ohittamiseen: BREX ja anti-BREX-strategiat biologisessa kilpavarustelussa

Tietueen suppeat tiedot
dc.contributor.authorSavilahti, Eero
dc.contributor.departmentfi=Biologian laitos|en=Department of Biology|
dc.contributor.facultyfi=Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta|en=Faculty of Science|
dc.contributor.studysubjectfi=Fysiologia ja genetiikka|en=Physiology and Genetics|
dc.date.accessioned2026-04-29T21:52:30Z
dc.date.issued2026-04-17
dc.description.abstractBakteerien ja bakteriofagien eli faagien välillä vallitsee evolutiivinen kilpavarustelu. Faageja vastaan bakteereille on kehittynyt lukuisia erilaisia puolustusjärjestelmiä. Useat järjestelmät sallivat faagien pääsyn bakteerin sisään, jossa ne tunnistetaan tunkeilijoiksi. Puolustusjärjestelmät tuhoavat faagit bakteerisolussa esimerkiksi katkaisemalla niiden DNA:n. BREX-puolustusjärjestelmä erottelee tunkeutuvan faagin bakteerista metyloituneiden emästen avulla. BREX:n metyylitransferaasi liittää isäntäbakteerin genomin spesifisiin emäksiin metyyliryhmiä. Faageilla ei ole kyseisiä metyylimerkkejä vastaavissa DNA-jaksoissaan. Kun faagi tunkeutuu bakteeriin, BREX-järjestelmä tunnistaa metyloimattomat tunnistusjaksot ja restriktoi faagin DNA:n toistaiseksi tuntemattomalla mekanismilla. Eri BREX-tyypit jaotellaan geenikoostumuksen ja toimintojen mukaan kuuteen eri luokkaan. Yleisin on tyypin 1 BREX, joka sisältää kuusi geeniä. Faageille on vastaavasti kehittynyt keinoja, joilla ne pystyvät ohittamaan bakteerien puolustusjärjestelmät. Faagien koodaama Ocr-proteiini on tyypillinen useiden bakteerien puolustusjärjestelmien, kuten BREX:n, inhiboija. Muita anti-BREX-proteiineja ovat OrbA ja SAMaasi, jotka ovat erikoistuneet BREX-järjestelmän inhibointiin. Anti-BREX-proteiinit toimivat joko inhiboimalla BREX-komponentteja tai BREX-puolustuksessa välttämättömiä kofaktoreita.
dc.format.extent27
dc.identifier.urihttps://www.utupub.fi/handle/11111/59909
dc.identifier.urnURN:NBN:fi-fe2026042131674
dc.language.isofin
dc.rightsfi=Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.|en=This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.|
dc.rights.accessrightsavoin
dc.subjectDNA-metylaatio
dc.subjectmetyylitransferaasi
dc.subjectBREX
dc.subjectanti-BREX-strategiat
dc.titleDNA-metylaatioon perustuvat bakteerien puolustusjärjestelmät ja virusten keinot niiden ohittamiseen: BREX ja anti-BREX-strategiat biologisessa kilpavarustelussa
dc.type.ontasotfi=Kandidaatintutkielma|en=Bachelor's thesis|

Tiedostot

Näytetään 1 - 1 / 1
Name:
Savilahti_Eero_opinnayte.pdf
Size:
763.29 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Lataa

Kokoelmat

Kandidaatin tutkielmat (kokotekstit)