Nielutulehduksia aiheuttaneiden A-streptokokkien emm-tyypit Varsinais-Suomessa
Ladataan...
992.47 KB
suljettu
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Lataukset1
Pysyvä osoite
Verkkojulkaisu
DOI
Tiivistelmä
Streptococcus pyogenes eli A-streptokokki (GAS, Group A Streptococcus) on kokkibakteeri, joka on merkittävä ihmisen taudinaiheuttaja. Sen aiheuttamien infektioiden vakavuusasteet vaihtelevat lievistä nielutulehduksista aina henkeä uhkaaviin invasiivisiin tautimuotoihin, kuten bakteremiaan, asti. Yleisin GAS:n aiheuttama tautimuoto on nielutulehdus, ja sairastavuus siihen on suurta ympäri maailman. GAS-nielutulehdukset aiheuttavat runsaasti kustannuksia, minkä lisäksi ne ovat aina riski invasiivisen infektion kehittymiselle. GAS-infektioiden epidemiologisessa tutkimuksessa käytetään usein emm-tyypitystä, joka perustuu bakteerin tärkeän virulenssitekijän, M-proteiinin, geenin sekvenssin määrittämiseen. emm-tyyppijakaumia on tutkittu paljon invasiivisista infektioista, mutta nielutulehduksista tutkimustuloksia on vähemmän. Tässä syventävien opintojen työssä tutkittiin Varsinais-Suomen sairaanhoitopiirissä eristettyjen GAS-nielutulehduskantojen emm-tyyppijakaumia. Lisäksi selvitettiin nielutulehdusta sairastaneiden potilaiden ikä- ja sukupuolijakaumia.
Tutkimukseen kerättiin kaikki Tyks kliinisen mikrobiologian osaston GAS-nielutulehduskannat helmi-maaliskuussa ja syys-lokakuussa 2017. Kantojen oikeellisuus varmistettiin kaupallisella agglutinaatiotestillä. Kaikille kannoille tehtiin emm-tyypitys käyttämällä High Resolution Melting (HRM) -menetelmää, joka tunnisti viisi emm-tyyppiä. HRM-menetelmän toimivuus varmistettiin ja menetelmällä negatiiviseksi jääneet kannat sekvensoitiin.
GAS-nielutulehduskantoja kerättiin yhteensä 357. Löydöksiä oli eniten ikäryhmässä 5-9 vuotta (23 % kaikista tapauksista). Miehillä löydöksiä oli eniten ikäryhmissä 0-9 vuotta ja naisilla 20-24 vuotta sekä 30-34 vuotta. Eri emm-tyyppejä löydettiin 19. Yleisimmät olivat emm89, emm12, emm28 ja emm1 (81 % tapauksista). Samojen emm¬-tyyppien tiedetään olevan yleisimpiä myös invasiivisissa GAS-infektioissa Suomessa. emm12 havaittiin yleisemmäksi keväällä ja emm89 syksyllä. Alle 5-vuotiailla emm12 ja 20-24-vuotiailla muut kuin tutkimuksen neljä yleisintä emm-tyyppiä havaittiin olevan yleisimpiä.