Selektiivinen asetalisaatio
3.94 MB
avoin
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Pysyvä osoite
Verkkojulkaisu
DOI
Tiivistelmä
Dimetoksitrityyli (DMTr) on vakiintunut 5´-OH:n suojaryhmänä syntetisoitaessa oligonukleotideja automatisoidusti kiinteällä kantajalla. Happolabiilimpi 2-metoksi-isopropyyli-suojaus (MIP) on varteenotettava vaihtoehto trityylisuojaryhmälle kehitettäessä kustannustehokkaampia ja vihreämpiä menetelmiä oligonukleotidien valmistamiseksi liuoksessa. Liuosfaasisynteesissä MIP-suojaryhmän etuna on sen pseudoirreversiibeli irtoaminen, joka tuottaa haihtuvia sivutuotteita asetonia ja metanolia. Lisäksi MIP on happolabiilimpi kuin DMTr, jolloin mahdollisena sivureaktiona muodostuvan depurinaation osuus vähenee.
Pro gradun johdanto-osiossa tarkastellaan nukleosidien ja hiilihydraattien asetalisaatiota ja sen selektiivisyyttä. Uridiinin primäärisen hydroksyyliryhmän selektiivistä asetalisaatiota on aikaisemmin tutkittu käyttämällä 2,2-dimetoksipropaania reagenssina ja di-p-nitrofenyylifosfaattia happokatalyyttinä N,N-dimetyyliasetamidissa.
Isopropylideeni ja bentsylideeni ovat kaksi yleisesti käytettyä suojaryhmää hiilihydraattien asetalisaatiossa, jossa happokatalyyttinä käytetään usein p-tolueenisulfonihappoa. Hiilihydraattien 2-metoksi-isopropyyli- sekä 1-metoksi-1-sykloheksyyliasetaalien synteeseissä on käytetty katalyyttinä kiraalisia fosforihappoja (CPA) parantamaan reaktion paikkaselektiivisyyttä. Myös zeoliitti-katalyyttejä on tutkittu ksyloosin ja aldehydin välisessä paikkaselektiivisessä asetalisaatiossa.
Projektin kokeellisessa osassa kehitettiin nukleosideille asetalisaatiomenetelmä, jossa nukleosidien 5´-hydroksyyliryhmä suojattiin selektiivisesti 2-metoksi-isopropyylillä pyridiinissä käyttäen 2-metoksipropeenia ja katalyyttinä p-tolueenisulfonihappoa. Suojatut nukleosidit fosfityloitiin fosforamidiiteiksi.