Selektiivinen asetalisaatio

Abstract

Dimetoksitrityyli (DMTr) on vakiintunut 5´-OH:n suojaryhmänä syntetisoitaessa oligonukleotideja automatisoidusti kiinteällä kantajalla. Happolabiilimpi 2-metoksi-isopropyyli-suojaus (MIP) on varteenotettava vaihtoehto trityylisuojaryhmälle kehitettäessä kustannustehokkaampia ja vihreämpiä menetelmiä oligonukleotidien valmistamiseksi liuoksessa. Liuosfaasisynteesissä MIP-suojaryhmän etuna on sen pseudoirreversiibeli irtoaminen, joka tuottaa haihtuvia sivutuotteita asetonia ja metanolia. Lisäksi MIP on happolabiilimpi kuin DMTr, jolloin mahdollisena sivureaktiona muodostuvan depurinaation osuus vähenee. Pro gradun johdanto-osiossa tarkastellaan nukleosidien ja hiilihydraattien asetalisaatiota ja sen selektiivisyyttä. Uridiinin primäärisen hydroksyyliryhmän selektiivistä asetalisaatiota on aikaisemmin tutkittu käyttämällä 2,2-dimetoksipropaania reagenssina ja di-p-nitrofenyylifosfaattia happokatalyyttinä N,N-dimetyyliasetamidissa. Isopropylideeni ja bentsylideeni ovat kaksi yleisesti käytettyä suojaryhmää hiilihydraattien asetalisaatiossa, jossa happokatalyyttinä käytetään usein p-tolueenisulfonihappoa. Hiilihydraattien 2-metoksi-isopropyyli- sekä 1-metoksi-1-sykloheksyyliasetaalien synteeseissä on käytetty katalyyttinä kiraalisia fosforihappoja (CPA) parantamaan reaktion paikkaselektiivisyyttä. Myös zeoliitti-katalyyttejä on tutkittu ksyloosin ja aldehydin välisessä paikkaselektiivisessä asetalisaatiossa. Projektin kokeellisessa osassa kehitettiin nukleosideille asetalisaatiomenetelmä, jossa nukleosidien 5´-hydroksyyliryhmä suojattiin selektiivisesti 2-metoksi-isopropyylillä pyridiinissä käyttäen 2-metoksipropeenia ja katalyyttinä p-tolueenisulfonihappoa. Suojatut nukleosidit fosfityloitiin fosforamidiiteiksi.